Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpv2Q9WTR1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms