Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trpc2Q9R244 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms