Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek3Q9R0A5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nek3Q9R0A5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nek3Q9R0A5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nek3Q9R0A5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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