Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms