Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh11Q9QYF1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms