Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tomm40Q9QYA2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms