Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Foxe3Q9QY14 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Foxe3Q9QY14 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxe3Q9QY14 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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