Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms