Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms