Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtsmQ9JL96 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtsmQ9JL96 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtsmQ9JL96 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtsmQ9JL96 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtsmQ9JL96 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtsmQ9JL96 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtsmQ9JL96 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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