Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gde1Q9JL56 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gde1Q9JL56 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gde1Q9JL56 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gde1Q9JL56 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms