Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Scamp4Q9JKV5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms