Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms