Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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