Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gpa33Q9JKA5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms