Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS9

Cwc15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc15Q9JHS9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cwc15Q9JHS9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cwc15Q9JHS9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms