Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC104794.2-201ENST00000567540 1572 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 CSTA-202ENST00000479204 821 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AL136088.1-201ENST00000531002 541 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 LINC01132-202ENST00000641214 1085 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 CXCL13-201ENST00000286758 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC010203.1-201ENST00000548404 928 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP3Q9H4L4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms