Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tspan4Q9DCK3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Tspan4Q9DCK3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tspan4Q9DCK3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tspan4Q9DCK3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tspan4Q9DCK3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tspan4Q9DCK3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tspan4Q9DCK3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tspan4Q9DCK3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tspan4Q9DCK3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tspan4Q9DCK3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tspan4Q9DCK3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tspan4Q9DCK3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tspan4Q9DCK3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tspan4Q9DCK3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tspan4Q9DCK3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tspan4Q9DCK3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms