Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms