Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9DAE8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9DAE8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9DAE8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9DAE8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9DAE8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9DAE8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9DAE8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms