Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp12Q9D9M2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms