Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms