Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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