Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms