Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms