Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl4Q9D8E6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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