Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsraQ9D6Y7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms