Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms