Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V6

Syap1, Synapse-associated protein 1, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syap1Q9D5V6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syap1Q9D5V6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syap1Q9D5V6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms