Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v1e2Q9D593 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms