Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7Q9D541 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms