Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf6Q9D4J7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms