Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp2bpQ9D4C6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms