Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D454 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D454 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D454 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D454 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D454 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D454 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D454 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D454 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms