Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms