Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms