Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms