Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D2Q3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms