Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms