Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D1F3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D1F3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms