Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc3Q9D114 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms