Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Snx7Q9CY18 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Snx7Q9CY18 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Snx7Q9CY18 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Snx7Q9CY18 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Snx7Q9CY18 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Snx7Q9CY18 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx7Q9CY18 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms