Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufaf1Q9CWX2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms