Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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