Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR35

Ctrb1, Chymotrypsinogen B, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctrb1Q9CR35 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ctrb1Q9CR35 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ctrb1Q9CR35 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ctrb1Q9CR35 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ctrb1Q9CR35 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ctrb1Q9CR35 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ctrb1Q9CR35 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ctrb1Q9CR35 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctrb1Q9CR35 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms