Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms