Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms