Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ubqln4Q99NB8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ubqln4Q99NB8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ubqln4Q99NB8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ubqln4Q99NB8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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