Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brms1Q99N20 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms