Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms